Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COX6A1P12074 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms