Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODC1P11926 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODC1P11926 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
ODC1P11926 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ODC1P11926 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODC1P11926 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODC1P11926 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODC1P11926 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms