Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SAA2P0DJI9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms