Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RGPD2P0DJD1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms