Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRAPPC2BP0DI82 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms