Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTXN2P0C2S0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms