Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJB1P08034 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJB1P08034 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJB1P08034 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJB1P08034 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB1P08034 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB1P08034 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB1P08034 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB1P08034 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB1P08034 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB1P08034 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB1P08034 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB1P08034 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB1P08034 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB1P08034 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms