Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV3-11P04433 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms