Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
COL4A1P02462 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL4A1P02462 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms