Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTR3BO95264 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms