Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BBOX1O75936 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BBOX1O75936 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms