Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SURF6O75683 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SURF6O75683 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SURF6O75683 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SURF6O75683 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SURF6O75683 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SURF6O75683 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms