Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP3O75154 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11FIP3O75154 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms