Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGSF3O75054 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF3O75054 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms