Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MSCO60682 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MSCO60682 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MSCO60682 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MSCO60682 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MSCO60682 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MSCO60682 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms