Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPAG9O60271 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPAG9O60271 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
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