Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP3LO60238 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms