Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFNA2O43921 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms