Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKAB2O43741 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms