Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNQ3O43525 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNQ3O43525 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms