Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF3O43395 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms