Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LRRTM2O43300 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRTM2O43300 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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