Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
J3KT08 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
J3KT08 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
J3KT08 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
J3KT08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms