Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLTPD2A6NH11 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLTPD2A6NH11 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLTPD2A6NH11 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLTPD2A6NH11 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GLTPD2A6NH11 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLTPD2A6NH11 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms