Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C9orf170A2RU37 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf170A2RU37 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms