Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms