Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms