Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms