Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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