Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms