Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FAM3AP98173 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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