Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NFASC-223ENST00000513543 3974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CATSPER1-201ENST00000312106 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TPCN1-204ENST00000541517 5173 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BTG2-201ENST00000290551 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RBM28-202ENST00000415472 2251 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 HPR-201ENST00000356967 1110 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MR1-203ENST00000367579 1154 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL512366.1-201ENST00000438919 636 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RPL13P6-201ENST00000488133 626 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TUBB4BP4-201ENST00000527023 304 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RAET1E-205ENST00000529948 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL079307.2-201ENST00000557308 448 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC138761.2-201ENST00000583878 343 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL365214.3-204ENST00000587816 894 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC004678.1-201ENST00000615016 929 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC027575.4-201ENST00000622010 586 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 KLKB1-201ENST00000264690 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CPEB1-216ENST00000618449 2459 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZNF619-210ENST00000522736 2030 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ITGA7-203ENST00000452168 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NR2F1-AS1-202ENST00000504474 2868 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC093642.2-201ENST00000625132 4805 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CPEB1-AS1-202ENST00000618020 2994 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC01588-208ENST00000554129 2301 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 OR11A1-204ENST00000641152 2440 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC126603.1-201ENST00000557586 2512 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DUOX1-211ENST00000561166 4539 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LAMA3-203ENST00000399516 9834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC034199.1-201ENST00000511921 2182 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ALDH1L1-206ENST00000455064 3137 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LRRC4C-201ENST00000278198 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ZNF135-204ENST00000506786 3349 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 DPF2-201ENST00000252268 2462 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LPAL2-205ENST00000639825 1536 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PTCH1-205ENST00000418258 7815 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CASQ2-201ENST00000261448 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 GNL3LP1-201ENST00000399458 1643 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SMPD4P2-201ENST00000440167 1634 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RFFL-205ENST00000415395 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 NVL-202ENST00000340871 2431 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 EPB42-201ENST00000300215 4553 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SLF2-203ENST00000370271 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC243772.2-201ENST00000428289 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PDE4DIP-219ENST00000524974 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PLA2G2C-201ENST00000247992 453 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PDE6H-201ENST00000266395 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PRG3-201ENST00000287143 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 WNT4-201ENST00000290167 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 APOM-201ENST00000375916 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL450346.1-201ENST00000403497 559 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FOLR2-203ENST00000449475 1242 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FOLR2-204ENST00000454954 951 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AP000781.1-201ENST00000534162 311 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CD160-204ENST00000584442 219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC020907.2-202ENST00000592174 728 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 KC6-202ENST00000593577 549 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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