Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms