Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTPRCP08575 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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