Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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