Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms