Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COPS7AQ9UBW8 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms