Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCSER1Q9C0I3 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCSER1Q9C0I3 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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