Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.3 ms