Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NTRK2Q16620 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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