Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CAST-222ENST00000508579 1758 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC110048.2-201ENST00000617013 6721 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HERC1Q15751 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HERC1Q15751 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ASTN1-202ENST00000361833 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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