Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 EEF1A1P27-201ENST00000429983 1135 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
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NCOA4Q13772 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NCOA4Q13772 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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