Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FHL3Q13643 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms