Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SP140Q13342 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SP140Q13342 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SP140Q13342 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SP140Q13342 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SP140Q13342 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SP140Q13342 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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