Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD4Q12950 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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