Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
TWF1Q12792 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms