Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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SREBF2Q12772 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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SREBF2Q12772 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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SREBF2Q12772 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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SREBF2Q12772 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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SREBF2Q12772 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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SREBF2Q12772 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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SREBF2Q12772 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SREBF2Q12772 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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