Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CENPFP49454 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CENPFP49454 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CENPFP49454 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms