Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
LTBRP36941 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LTBRP36941 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LTBRP36941 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LTBRP36941 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
LTBRP36941 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
LTBRP36941 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms