Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PLEKHA6-201ENST00000272203 7401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC010643.1-201ENST00000599433 3263 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NGRN-202ENST00000379095 7237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZFP57-202ENST00000376883 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNF165-201ENST00000269439 7596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FBN2-201ENST00000262464 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 WDR62-201ENST00000270301 4632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PADI3-201ENST00000375460 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 OVCH2-201ENST00000533663 1921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LOX-201ENST00000231004 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BTBD18-201ENST00000422652 3044 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TCF4-205ENST00000537578 2767 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CCDC144B-208ENST00000618081 8688 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL359075.2-201ENST00000354921 4998 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZBTB14-208ENST00000615385 3350 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 WFDC3-203ENST00000372630 597 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ACSM4-201ENST00000399422 2142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ATP5HP4-201ENST00000414313 475 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 E2F4P1-201ENST00000422443 1133 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL162584.1-201ENST00000437097 633 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZEB1-AS1-203ENST00000441257 585 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 COX7CP1-201ENST00000446556 192 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ELOBP1-201ENST00000447693 357 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC02543-201ENST00000451285 845 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SL845P-201ENST00000484385 290 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 OR7E85P-201ENST00000512164 985 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC104042.1-201ENST00000524806 883 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL929601.1-202ENST00000551067 418 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 C14orf178-203ENST00000556047 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC010650.1-201ENST00000567559 494 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC027688.1-201ENST00000568471 584 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC125421.2-202ENST00000580776 477 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ORMDL3-208ENST00000584220 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 SMIM2-AS1-203ENST00000618753 2101 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 GLOD4-218ENST00000625892 111 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 C2orf83-204ENST00000641422 291 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RBM19-203ENST00000545145 4422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 IGBP1-201ENST00000342206 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 ZBTB20-202ENST00000393785 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CCDC83-202ENST00000342404 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC02292-201ENST00000554522 1701 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PCDHGB6-201ENST00000520790 4599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 WASF4P-201ENST00000444248 1494 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SYN3-202ENST00000358763 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PAX9-201ENST00000361487 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FPGT-TNNI3K-206ENST00000557284 2855 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZBTB43-202ENST00000373464 5965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 GALK2-216ENST00000560031 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ASB9-203ENST00000380488 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MC1R-203ENST00000555427 3637 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 INPP4A-210ENST00000523221 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CACNA1C-210ENST00000399606 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CACNA1C-212ENST00000399621 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CACNA1C-215ENST00000399637 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CACNA1C-216ENST00000399638 6595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CACNA1C-221ENST00000402845 6568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 XRCC6-205ENST00000405878 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC114811.2-201ENST00000569927 5647 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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